SDK do Databricks para R
Observação
Este artigo aborda o SDK do Databricks para R da Databricks Labs, que está em um estado Experimental . Para fornecer comentários, fazer perguntas e relatar problemas, use a guia Problemas no repositório Databricks SDK para R no GitHub.
Neste artigo, o senhor aprenderá a automatizar Databricks operações no espaço de trabalho Databricks com o Databricks SDK para R. Este artigo complementa a documentação do siteDatabricks SDK for R.
Observação
O site Databricks SDK for R não oferece suporte à automação de operações na conta Databricks. Para chamar operações no nível da conta, use um SDK Databricks diferente, por exemplo:
Antes de começar
Antes de começar a usar o Databricks SDK para R, sua máquina de desenvolvimento deve ter:
Um access tokenpessoal do Databricks para o workspace do Databricks de destino que você deseja automatizar.
Observação
O SDK do Databricks para R dá suporte apenas à autenticação access tokens pessoal do Databricks.
R e, opcionalmente, um ambiente de desenvolvimento integrado (IDE) compatível com R. A Databricks recomenda o RStudio Desktop e o utiliza nas instruções deste artigo.
Comece a usar o Databricks SDK para R
Disponibilize a URL do seu workspace Databricks e access tokens pessoal para os scripts do seu projeto R. Por exemplo, você pode adicionar o seguinte ao arquivo
.Renviron
de um projeto R. Substitua<your-workspace-url>
pelo URL da instância do espaço de trabalho, por exemplo,https://1234567890123456.7.gcp.databricks.com
. Substitua<your-personal-access-token>
pelos access tokens pessoal do Databricks, por exemplo,dapi12345678901234567890123456789012
.DATABRICKS_HOST=<your-workspace-url> DATABRICKS_TOKEN=<your-personal-access-token>
Para criar um Databricks pessoal access token, siga os passos em Databricks pessoal access tokens para usuários workspace .
Para obter formas adicionais de fornecer a URL workspace do Databricks e access tokens pessoal, consulte Autenticação no repositório Databricks SDK para R no GitHub.
Importante
Não adicione arquivos
.Renviron
aos sistemas de controle de versão, pois isso corre o risco de expor informações confidenciais, como access token pessoal do Databricks.Instale o pacote Databricks SDK para R. Por exemplo, no RStudio Desktop, na view Console (view > Move Focus to Console), execute os seguintes comandos, um por vez:
install.packages("devtools") library(devtools) install_github("databrickslabs/databricks-sdk-r")
Observação
O pacote Databricks SDK para R não está disponível no CRAN.
Adicione o código para referenciar o SDK do Databricks para R e listar todos os clusters em seu workspace do Databricks. Por exemplo, no arquivo
main.r
de um projeto, o código pode ser o seguinte:require(databricks) client <- DatabricksClient() list_clusters(client)[, "cluster_name"]
execução do seu script. Por exemplo, no RStudio Desktop, no editor de script com o arquivo
main.r
de um projeto ativo, clique em Fonte > Fonte ou Fonte com Echo.A lista de clusters é exibida. Por exemplo, no RStudio Desktop, isso está na view Console .
Exemplos de código
Os exemplos de código a seguir demonstram como usar o Databricks SDK para R para criar e excluir clusters e criar Job.
Criar um clusters
Este exemplo de código cria clusters com a versão especificada do Databricks Runtime e o tipo de nó clusters . Esses clusters têm um worker e os clusters são encerrados automaticamente após 15 minutos de tempo de parada.
require(databricks)
client <- DatabricksClient()
response <- create_cluster(
client = client,
cluster_name = "my-cluster",
spark_version = "12.2.x-scala2.12",
node_type_id = "n2-highmem-4",
autotermination_minutes = 15,
num_workers = 1
)
# Get the workspace URL to be used in the following results message.
get_client_debug <- strsplit(client$debug_string(), split = "host=")
get_host <- strsplit(get_client_debug[[1]][2], split = ",")
host <- get_host[[1]][1]
# Make sure the workspace URL ends with a forward slash.
if (endsWith(host, "/")) {
} else {
host <- paste(host, "/", sep = "")
}
print(paste(
"View the cluster at ",
host,
"#setting/clusters/",
response$cluster_id,
"/configuration",
sep = "")
)
Excluir permanentemente um clusters
Este exemplo de código exclui permanentemente os clusters com o ID clusters especificado do workspace.
require(databricks)
client <- DatabricksClient()
cluster_id <- readline("ID of the cluster to delete (for example, 1234-567890-ab123cd4):")
delete_cluster(client, cluster_id)
Criar um Job
Este exemplo de código cria um Job do Databricks que pode ser usado para executar o Notebook especificado nos clusters especificados. Como esta execução de código, ele obtém o caminho do Notebookexistente, o ID clusters existentes e as configurações Job relacionadas do usuário no console.
require(databricks)
client <- DatabricksClient()
job_name <- readline("Some short name for the job (for example, my-job):")
description <- readline("Some short description for the job (for example, My job):")
existing_cluster_id <- readline("ID of the existing cluster in the workspace to run the job on (for example, 1234-567890-ab123cd4):")
notebook_path <- readline("Workspace path of the notebook to run (for example, /Users/someone@example.com/my-notebook):")
task_key <- readline("Some key to apply to the job's tasks (for example, my-key):")
print("Attempting to create the job. Please wait...")
notebook_task <- list(
notebook_path = notebook_path,
source = "WORKSPACE"
)
job_task <- list(
task_key = task_key,
description = description,
existing_cluster_id = existing_cluster_id,
notebook_task = notebook_task
)
response <- create_job(
client,
name = job_name,
tasks = list(job_task)
)
# Get the workspace URL to be used in the following results message.
get_client_debug <- strsplit(client$debug_string(), split = "host=")
get_host <- strsplit(get_client_debug[[1]][2], split = ",")
host <- get_host[[1]][1]
# Make sure the workspace URL ends with a forward slash.
if (endsWith(host, "/")) {
} else {
host <- paste(host, "/", sep = "")
}
print(paste(
"View the job at ",
host,
"#job/",
response$job_id,
sep = "")
)
Registro em log
O senhor pode usar o popular pacote logging
para log mensagens. Esse pacote oferece suporte a vários níveis de registro e formatos personalizados do site log. O senhor pode usar esse pacote para log mensagens no console ou em um arquivo. Para log mensagens, faça o seguinte:
Instale o pacote
logging
. Por exemplo, no RStudio Desktop, no Console view (view > Move Focus to Console), execute o seguinte comando:install.packages("logging") library(logging)
Inicialize o pacote de registro, defina onde log as mensagens e defina o nível de registro. Por exemplo, o código a seguir logs todas as mensagens
ERROR
e abaixo para o arquivoresults.log
.basicConfig() addHandler(writeToFile, file="results.log") setLevel("ERROR")
log mensagens conforme necessário. Por exemplo, o código a seguir logs qualquer erro se o código não puder autenticar ou listar os nomes dos clusters disponíveis.
require(databricks) require(logging) basicConfig() addHandler(writeToFile, file="results.log") setLevel("ERROR") tryCatch({ client <- DatabricksClient() }, error = function(e) { logerror(paste("Error initializing DatabricksClient(): ", e$message)) return(NA) }) tryCatch({ list_clusters(client)[, "cluster_name"] }, error = function(e) { logerror(paste("Error in list_clusters(client): ", e$message)) return(NA) })
Testes
Para testar seu código, você pode usar estruturas de teste R, como testthat. Para testar seu código em condições simuladas sem chamar o endpoint Databricks REST API ou alterar o estado de sua conta ou espaço de trabalho Databricks, o senhor pode usar a biblioteca de simulação do R, como o mockery.
Por exemplo, dado o seguinte arquivo chamado helpers.r
contendo uma função createCluster
que retorna informações sobre o novo cluster:
library(databricks)
createCluster <- function(
databricks_client,
cluster_name,
spark_version,
node_type_id,
autotermination_minutes,
num_workers
) {
response <- create_cluster(
client = databricks_client,
cluster_name = cluster_name,
spark_version = spark_version,
node_type_id = node_type_id,
autotermination_minutes = autotermination_minutes,
num_workers = num_workers
)
return(response)
}
E dado o seguinte arquivo chamado main.R
que chama a função createCluster
:
library(databricks)
source("helpers.R")
client <- DatabricksClient()
# Replace <spark-version> with the target Spark version string.
# Replace <node-type-id> with the target node type string.
response = createCluster(
databricks_client = client,
cluster_name = "my-cluster",
spark_version = "<spark-version>",
node_type_id = "<node-type-id>",
autotermination_minutes = 15,
num_workers = 1
)
print(response$cluster_id)
O arquivo a seguir, denominado test-helpers.py
, testa se a função createCluster
retorna a resposta esperada. Em vez de criar um cluster no destino workspace, esse teste simula um objeto DatabricksClient
, define as configurações do objeto simulado e, em seguida, passa o objeto simulado para a função createCluster
. Em seguida, o teste verifica se a função retorna a ID esperada do novo cluster simulado.
# install.packages("testthat")
# install.pacakges("mockery")
# testthat::test_file("test-helpers.R")
lapply(c("databricks", "testthat", "mockery"), library, character.only = TRUE)
source("helpers.R")
test_that("createCluster mock returns expected results", {
# Create a mock response.
mock_response <- list(cluster_id = "abc123")
# Create a mock function for create_cluster().
mock_create_cluster <- mock(return_value = mock_response)
# Run the test with the mock function.
with_mock(
create_cluster = mock_create_cluster,
{
# Create a mock Databricks client.
mock_client <- mock()
# Call the function with the mock client.
# Replace <spark-version> with the target Spark version string.
# Replace <node-type-id> with the target node type string.
response <- createCluster(
databricks_client = mock_client,
cluster_name = "my-cluster",
spark_version = "<spark-version>",
node_type_id = "<node-type-id>",
autotermination_minutes = 15,
num_workers = 1
)
# Check that the function returned the correct mock response.
expect_equal(response$cluster_id, "abc123")
}
)
})